Добрый день!
Цитата: Мы являемся некоммерческой организацией.Система налогообложения - УСН 6 %. Уставной деятельностью является научная и просветительская деятельность. Должны ли мы заплатить налог 6 % при заключении договора на оказание услуг по организации и подготовке к проведению - конференции молодых ученых".
Да, Вы оказываете возмездные услуги. Не за счет "оргвносов" участников и не за счет каких-то других взносов или целевого бюджетного финансирования.
Это для Заказчика мероприятие может быть профинансировано из бюджета, а Вам платит деньги заказчик. И это вполне коммерческая деятельность.
Доходы от которой должны быть включены в налогооблагаемую базу для УСН.
Однако я заметил одну настораживающую деталь.
В приложении к договору (спецификации) в числе Ваших обязанностей по проведению конференции есть такая:
"Обеспечить согласование списков участников конференции и
сбор оргвзносов;".
Конференцию Вы проводите по заданию Заказчика, который ее полностью оплачивает. А оргвзносы на что? Куда и кому они потом идут?
Главное, чтобы они не выпали из налогообложения.
Успехов!